碱基顺序比对工具 - Sequence Manipulation Suite

碱基顺序比对工具(按碱基标颜色)可以将FASTA格式或者GDE格式的多条序列,逐个碱基进行比对,根据比对情况标记相应的颜色。与Blast不同,它不会考虑gap,它只是简单按照碱基顺序逐一进行比较。特定碱基位如果完全相同则标记为黑色,如果不完全相同则标记为灰色,如果完全不同则留为白色。您可以控制碱基相似率,大于这个相似率即可显示为黑色背景。

输入多条FASTA格式或GDE格式的序列,长度限定在200000个字符.

使用此工具之前,请详细了解浏览器兼容性 要求.
  • 每行显示 个碱基.
  • 碱基相同率达到多少,可认为是序列一致:
  • 颜色标记方法 .
输入一组相似氨基酸并用逗号隔开,它将被用于相似程度计算。如果您是要比对DNA序列,请留空。


输入每条序列比对时的开始位置,并用逗号隔开,顺序请保持与序列顺序一致. 形式如: 0, 200, 0, -1. 如果没有指定,则默认为从第一位置(0位)开始。

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* 您可以镜像此工具到自己的网站 or 也可以单机使用。

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Thu Aug 27 17:17:36 2015
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